Nouvelles approches en génétique des populations et en épidémiologie génétique pour l’étude des caractères complexes – Subventions de fonctionnement (Archivé)
Institut de génétique
Appel de demandes
| Dates importantes | |
| Annonce de la possibilité : | Juin 2005 |
| Dernière mise à jour du contenu : | 20 décembre 2005 |
| Le 1er décembre 2005 | Date limite d'inscription - Les dossiers d'inscription doivent être envoyés au plus tard à cette date, le cachet du service de messagerie en faisant foi. |
| Le 16 janvier 2006 | Date limite d'inscription - Les demandes détaillées doivent être envoyées au plus tard à cette date, le cachet du service de messagerie en faisant foi. |
| Avril 2006 | Date prévue de la notification de la décision. |
| Avril 2006 | Date de début prévue. |
| Sommaire | |
| Ce programme a pour but de renforcer les capacités de recherche dans le domaine de la génétique des populations et de l'épidémiologie génétique des maladies complexes. Cette initiative aidera des personnes ou des équipes à développer et à évaluer les nouvelles théories, stratégies et méthodologies nécessaires pour faciliter des études étiologiques plus concluantes, de haute qualité sur de telles maladies. Fonds disponibles : La contribution des IRSC au montant disponible pour cette initiative est assujettie à la disponibilité des fonds accordés annuellement aux IRSC par l'entremise de crédits parlementaires, et aux conditions qui peuvent y être rattachées.
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Table des matières
Contexte
Partenaires
Objectifs et domaines de recherche pertinents
Admissibilité
Coûts admissibles
Processus d'examen par les pairs et critères d'évaluation
Lignes directrices générales des IRSC
Conditions de financement
Exigences en matière de communication
Surveillance, mesure des résultats et évaluation
Comment faire une demande
Coordonnées
Description des partenaires
Contexte
La génétique humaine est entrée dans l'ère du génome. Une séquence annotée complète du génome humain, précise à 99,9 %, sera accessible au public, de même qu'un contig, accompagné d'une séquence complète et d'une annotation très précise des gènes, sera disponible pour de nombreuses régions génomiques. Les données récemment publiées par le projet International Haplotype Map et d'autres projets sur le génotypage de millions de SNP ont donné jour à de nouveaux outils. Une des prochaines étapes importantes consiste à commencer à démêler les composantes génétiques des maladies complexes, les facteurs génétiques qui influencent les maladies déterminées par un seul gène, ainsi que leurs effets combinés aux influences environnementales.
Le diabète, la migraine, l'hypertension artérielle, les maladies auto-immunes, la sclérose en plaques, les troubles bipolaires ainsi que la dyslexie et l'hyperactivité avec déficit de l'attention sont des exemples traditionnels de maladies génétiques complexes. D'autres exemples incluent les maladies dites à caractère mendélien qui sont influencées par d'autres facteurs (gènes qui interagissent entre eux, séquences d'ADN qui agissent en cis ou en en trans ou facteurs environnementaux), ainsi que par la réaction aux médicaments (pharmacogénétique) ou par le phénotype biochimique (comme les taux de protéines ou de lipides spécifiques). Les maladies génétiques complexes (et leurs phénotypes associés) sont courantes dans la population en général et particulièrement dans une population vieillissante et, par conséquent, ont des effets socioéconomiques très importants sur le système de soins de santé. Certains des avantages les plus importants des études sur la génétique humaine pour la population en général découleront de l'éclaircissement des facteurs génétiques et environnementaux sous-jacents des maladies génétiques; la recherche en épidémiologie génétique sera principalement axée sur ces maladies au cours de la prochaine décennie. En raison de la complexité de l'étiologie et de l'expression de beaucoup de phénotypes, c'est-à-dire parce qu'ils sont multifactoriels et que de multiples gènes y contribuent, la démarche consistant à identifier les gènes en cause n'est pas simple, et ne peut être réalisée à l'aide des outils statistiques et génétiques traditionnels qui ont servi à identifier les maladies monogéniques. Par ailleurs, les méthodologies traditionnelles sont vraisemblablement de peu d'utilité. Par conséquent, il faudra adopter des méthodologies novatrices et différentes stratégies analytiques pour démêler l'architecture génétique des maladies génétiques complexes, ainsi que celles déterminées par un seul gène et qui sont influencées par d'autres facteurs génétiques et environementaux. En ce qui concerne les études d'association des marqueurs-maladies, les approches fondées sur l'exploration du génome entier comporteront le génotypage potentiel de centaines de milliers de SPN chez des centaines ou des milliers d'individus normaux ou atteints de maladie. D'autre part, des analyses de liens bien conçues peuvent également s'avérer importantes pour déterminer les loci de susceptibilité, plus particulièrement lorsqu'il existe un degré élevé d'hétérogénéité allélique. La méthodologie de l'étude est d'une importance cruciale dans le cadre de tels projets.
Des études statistiques préliminaires sur la capacité de déceler, de localiser et de quantifier les associations de marqueurs-maladies pour les populations disponibles sont nécessaires. De plus, il est primordial de développer des outils analytiques qui permettent de faire front aux complexités inhérentes à des études aussi complexes et d'une telle envergure. Une fois que les loci de susceptibilité auront été déterminés, des études détaillées des interactions entre les gènes et l'environnement dans certaines populations bien précises pourront fournir des données au sujet des risques relatifs pour les individus ayant des génotypes particuliers, et des facteurs de risque environnementaux qu'ils devraient éviter. Des efforts à l'échelle internationale sont actuellement en cours dans tous ces domaines.
Le Canada a la chance de jouer un rôle au sein d'activités internationales importantes et d'élaborer de nouvelles connaissances particulièrement importantes pour la compréhension de l'étiologie des maladies génétiques complexes dans la population canadienne. Il faut de nouveaux modèles et de nouvelles méthodes en génétique des populations et en épidémiologie génétique pour faciliter l'étude de ces maladies qui ont une importante composante génétique.
Partenaires
L'Institut de génétique est déterminé à établir des collaborations avec d'autres instituts, directions, bureaux des IRSC, organismes de financement et intervenants afin d'accroître les fonds disponibles pour cette initiative stratégique, et de créer, là où il convient de le faire, des possibilités d'échange et d'application des connaissances correspondant aux paramètres de la présente initiative. Les candidats sont invités à consulter la page Descriptions des partenaires pour prendre connaissance de la liste des partenaires et de leurs mandats respectifs ou de leurs intérêts stratégiques. Cette liste continuera de s'allonger à mesure que de nouveaux partenaires se joindront à l'initiative. Les domaines de recherche particuliers et les exigences de chaque partenaire sont décrits brièvement dans la section « Objectifs et domaines de recherche pertinents » .
Objectifs et domaines de recherche pertinents
Les objectifs particuliers de cette initiative sont les suivants :
- Fournir un fondement méthodologique solide aux initiatives stratégiques à plus long terme visant la recherche sur les interactions entre les facteurs génétiques et environnementaux qui déterminent la santé et la maladie au Canada, et fournir des preuves en vue d'appuyer les décisions concernant la conception, la mise en oeuvre et l'analyse des études fondées sur la population.
- Aborder les questions fondamentales en matière de conception et de méthodologie des études sur les caractères complexes et les troubles génétiques, et élaborer de nouvelles démarches en matière de génétique des populations, de génétique statistique et d'épidémiologie génétique.
- Appuyer, promouvoir et renforcer le bassin d'excellents chercheurs dans le domaine de la génétique des populations, de la génétique mathématique et statistique et de l'épidémiologie génétique des maladies complexes et des troubles génétiques au Canada.
Principaux domaines de recherche admissibles
- cadres conceptuels en ce qui concerne les interactions entre les gènes et l'environnement;
- les modèles pour l'historique et la structure des populations, et les incidences sur les maladies génétiques;
- les modèles efficaces d'études par cohorte visant à déceler les interactions entre les gènes et l'environnement;
- des méthodes d'estimation et d'évaluation des haplotypes pour les troubles génétiques complexes ou les troubles associés à un seul gène;
- l'élaboration et l'évaluation de méthodes de perfectionnement des associations entre les phénotypes et les génotypes;
- des modèles et des méthodes d'études efficaces permettant l'identification des gènes dans le contexte de phénotypes très complexes;
- des méthodes analytiques visant à intégrer les données génomiques et fonctionnelles;
- la conception et l'analyse des hybrides ou des séquences pour les études de la population en général et des populations fondatrices;
- l'application des données de la carte haplotype aux populations canadiennes;
- l'intégration de données expérimentales, des modèles animaux de maladies humaines, p. ex., à la conception et à l'analyse des études sur les populations humaines;
- le développement de logiciels visant à améliorer l'efficacité informatique des applications génétiques statistiques permettant l'analyse des caractères complexes;
- la modélisation génétique des phénotypes complexes (par exemple, des caractères multivariés, longitudinaux, récurrents, d'apparition variable, censurés) qui présentent des variations quantitatives.
Les demandes devront être axées sur des questions saillantes bien précises liées à la conception de la recherche et au renforcement de l'indépendance intellectuelle et de la formation au moyen de la recherche.
Les candidats sont encouragés à se joindre à des groupes de recherche canadiens qui peuvent fournir un accès aux ensembles de données pour tester les modèles, les méthodes et les logiciels ou fournir un accès aux ensembles de données provenant des initiatives à grande échelle planifiant des études de cohortes canadiennes et qui comprennent une approche génétique.
Admissibilité
Les critères d'admissibilité pour tous les programmes de financement de la recherche des IRSC s'appliquent. Les fonds octroyés par les IRSC sont en général gérés par le service des finances de l'établissement où se trouve le candidat principal désigné. Veuillez consulter les Conditions d'admissibilité aux subventions et aux bourses des IRSC pour en apprendre davantage sur les conditions d'admissibilité pour les particuliers et les établissements.
Coûts admissibles
Les candidats devraient examiner -A9">Utilisation des fonds de subvention et -A10">Admissibilité des dépenses, emploi financé par les subventions qui se trouvent dans les Lignes directrices générales sur toutes les subventions de recherche pour la liste et la description détaillée des coûts et des activités admissibles.
Tous les coûts doivent être entièrement justifiés dans la demande détaillée.
Principaux coûts admissibles
- salaires des stagiaires en recherche, tels que décrits dans les Lignes directrices générales pour tous les programmes de bourses de formation en recherche.
Processus d'examen par les pairs et critères d'évaluation
Un comité d'examen par les pairs des IRSC évaluera les demandes détaillées. Ce comité peut être l'un des comités des IRSC qui existent déjà ou peut être créé expressément pour le présent appel de demandes. Les membres du comité seront choisis parmi les noms proposés par de nombreuses sources, dont les instituts, les portefeuilles ou les partenaires conformément à la Politique des IRSC sur les conflits d'intérêts, la confidentialité et la protection des renseignements personnels dans l'examen par les pairs. Pour de plus amples renseignements sur le processus d'examen par les pairs des IRSC, consultez la section Examen par les pairs.
L'examen par les pairs sera effectué selon Le processus d'examen par les pairs des IRSC : Politique et responsabilités des membres des comités, y compris les critères d'évaluation habituels décrits à la section « Facteurs afférents à l'évaluation » (section 6.2).
De plus, les critères d'évaluation suivants, propres au présent appel de demande, s'appliquent. Les IRSC reconnaissent que les demandes mettront l'accent sur différentes approches en matière de recherche et d'application des connaissances; il est donc entendu que les examinateurs et les comités évalueront les questions suivantes différemment d'une demande à l'autre.
- Pertinence des domaines de recherche admissibles, telle que décrite dans le présent appel de demandes.
En se fondant sur le total des fonds disponibles pour l'initiative, les demandes les mieux classées seront financées dans un ordre descendant, jusqu'à épuisement du budget. Les demandes ayant obtenu une note inférieure à 3,7 ne seront pas admissibles au financement.
Lignes directrices générales des IRSC
Le présent appel de demandes respecte les -A">Lignes directrices générales sur toutes les subventions de recherche.
Conditions de financement
Toutes les conditions énoncées dans les Politiques générales sur les subventions et bourses des IRSC s'appliquent aux subventions financées dans le cadre du présent appel de demandes. Ces conditions portent sur des aspects comme les responsabilités du candidat et de l'établissement, l'éthique, la Politique sur les langues officielles, les lois sur l'accès à l'information et la protection des renseignements personnels, et la reconnaissance de l'aide des IRSC. Les candidats retenus seront informés de toute condition financière particulière avant l'attribution des fonds ou lorsqu'ils recevront le formulaire d'autorisation de financement des IRSC.
Loi sur l'accès à l'information, Loi sur la protection des renseignements personnels, et Loi sur la protection des renseignements personnels et les documents électroniques (LPRPDE)
Tous les renseignements personnels recueillis par les IRSC sur les candidats servent à l'examen des demandes de financement, à la gestion et au contrôle des bourses et des subventions, à la compilation de statistiques ainsi qu'à la promotion et au soutien de la recherche en santé au Canada. Compte tenu de ces objectifs, les candidats doivent s'attendre à ce que les renseignements recueillis puissent être utilisés tel qu'énoncé dans Utilisation et divulgation de renseignements personnels fournis aux IRSC pour l'examen par les pairs.
À titre d'organisme fédéral, les IRSC sont assujettis à la Loi sur l'accès à l'information et à la Loi sur la protection des renseignements personnels, si bien que les dispositions de ces deux lois s'appliqueront à tous les renseignements contenus dans les prémisses des IRSC, y compris, sans restriction, les ententes de partage des coûts liées au présent appel de demandes et tout ce qui s'y rapporte.
Les parties, tout en respectant l'application de la Loi sur la protection des renseignements personnels pour les entités fédérales, seront également assujetties à la LPRPDE. Tous les renseignements personnels (tels que définis dans la LPRPDE) recueillis, utilisés ou communiqués dans le cadre d'activités commerciales en vertu des ententes de partage des coûts liées au présent appel de demandes seront recueillis, utilisés ou communiqués conformément à la LPRPDE.
Exigences en matière de communication
Les titulaires de subvention sont tenus de souligner la participation des IRSC, de leurs instituts et des partenaires dans toute communication ou publication relative au projet. Si vous désirez obtenir les détails au sujet des exigences des IRSC en matière de communication, consultez Mention de l'aide des IRSC qui se trouve dans les Politiques générales sur les subventions et bourses des IRSC. Les instituts ou les partenaires contributeurs seront énumérés dans la lettre de décision et l'autorisation de financement.
Surveillance, mesure des résultats et évaluation
Les IRSC s'engagent à montrer aux Canadiens les résultats obtenus grâce aux sommes investies dans la recherche en santé. Des mécanismes sont donc prévus pour surveiller les progrès et l'utilisation adéquate des fonds de même que pour mesurer les résultats et évaluer les programmes. Par conséquent, les bénéficiaires de financement doivent :
- contribuer à la surveillance, à l'examen et à l'évaluation des programmes, politiques et processus des IRSC en participant à des études d'évaluation, à des sondages, à des ateliers et à des vérifications, et en fournissant au besoin des données ou des rapports pour amasser de l'information en vue d'évaluer les progrès et les résultats;
- encourager leurs associés, stagiaires et l'administration à participer à la surveillance, à l'examen et à l'évaluation des programmes, politiques et processus des IRSC au besoin.
Comment faire une demande
La présentation d'une demande se fait en deux étapes : inscription et demande détaillée.
Les candidats sont priés d'examiner les instructions du processus de demande dans le guide Comment faire une demande de financement.
Choisissez Subvention de fonctionnement (Inscription et Demande) à partir de Dossier de demande.
Il faut suivre d'autres instructions pour le présent appel de demandes.
- Dans la section Programme de financement de la recherche du module Recherche (page 7 du rapport imprimé du formulaire Web), choisissez « Initiative stratégique/Appel de demandes » et entrez le titre du présent appel de demandes.
Envoyez la demande détaillée par messagerie à :
OBJET : « Nouvelles approches en génétique des populations et en épidémiologie génétique pour l'étude des caractères complexes - Subventions de fonctionnement »
Instituts de recherche en santé du Canada
160, rue Elgin, pièce 97
Indice de l'adresse : 4809A
Ottawa (Ontario) K1A 0W9
Coordonnées
Pour des questions sur les lignes directrices des IRSC concernant le financement, la présentation de demandes et le processus d'examen par les pairs, communiquez avec :
Jennifer Ralph (Mise à jour : 2005-12-20)
Agente, Éxecution des programmes
Instituts de recherche en santé du Canada
Téléphone : (613) 941-1068
Télécopieur : (613) 954-1800
Courriel : jralph@irsc-cihr.gc.ca
Pour des questions sur la présente initiative et les objectifs de recherche, communiquez avec :
Milka Popov
Directrice adjointe, Institut de génétique
123, rue Edward, local 1211
Toronto, ON M5G 1E2
Téléphone : (416) 813-7670
Télécopieur : (416) 813-7673
Courriel : milkaig@sickkids.ca
Description des partenaires : Instituts des IRSC et organisations partenaires
Remarque : On s'attend à ce que d'autres partenaires, y compris des partenaires de l'industrie et du secteur privé, se joignent à la présente initiative de financement au cours de l'année qui vient.
Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)
Les IRSC sont le principal organisme fédéral responsable du financement de la recherche en santé au Canada. Leur objectif est d'exceller, selon les normes internationales reconnues de l'excellence scientifique, dans la création de nouvelles connaissances et leur application en vue d'améliorer la santé de la population canadienne, d'offrir de meilleurs produits et services de santé et de renforcer le système de santé au Canada.
Institut de génétique des IRSC
L' IG des IRSC appuie la recherche sur le génome humain et les génomes modèles, ainsi que sur tous les aspects de la génétique, de la biochimie fondamentale et de la biologie cellulaire liés à la santé et aux maladies, notamment l'application des connaissances en politiques et en pratiques de santé, et aux conséquences sociétales des découvertes génétiques.
